龙胆苦苷生物合成候选调控基因GrbHLH1的挖掘、克隆与表达分析

作者：李彩霞; 王元忠; 王梅媛; 梁芳; 张晓东^*

来源：生命科学研究, 2020, 24(02): 118-126.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2020.02.005

• 滇龙胆
• 龙胆苦苷
• GrbHLH1基因
• 共表达分析
• 基因克隆
• 组织特异性表达分析

为挖掘滇龙胆中调控龙胆苦苷生物合成的bHLH转录因子,使用长春花中调控环烯醚萜生物合成的转录因子bHLH环烯醚萜类合成1 (CrBIS1)的基因序列比对滇龙胆转录组数据库,获得一个候选调控基因GrbHLH1,以该序列为基础,采用逆转录多聚酶链式反应(reverse transcription PCR, RT-PCR)技术从滇龙胆幼叶克隆GrbHLH1基因,并对其进行生物信息学分析和组织特异性表达分析。结果表明滇龙胆GrbHLH1基因(GenBank登录号:KF941186.2)的开放阅读框长1 104 bp,编码367个氨基酸,主要在叶中表达; GrbHLH1蛋白的相对分子质量为40.60 kD,理论pI为4.82,可能定位于细胞核,无信号肽,亲水、不稳定,主要由α-螺旋(18.53%)和环(70.30%)构成;该蛋白质具有HLH保守结构域,属于IVa型bHLH转录因子,与长春花CrBIS1和CtBIS2蛋白的亲缘关系最近。以上数据表明GrbHLH1基因是龙胆苦苷生物合成的候选调控基因,为进一步研究该基因的调控作用奠定了基础。

• 单位
  玉溪师范学院; 云南省农业科学院药用植物研究所; 许昌学院; 食品与生物工程学院