人甲状腺乳头状癌的环状RNA表达谱研究

作者：李姗姗^*; 郭敏; 王严; 宋玲玲; 马翠; 陆萍

来源：国际遗传学杂志, 2018, 41(05): 348-354.

• 甲状腺乳头状癌
• 环状RNA
• 芯片
• 非编码RNA

目的为探讨甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)的发病机制,采用基因芯片技术,分析circular RNAs(circRNAs)在甲状腺乳头状癌及其癌旁组织中的表达谱差异及临床意义。方法收集3例手术切除的甲状腺乳头状癌组织及对应癌旁组织,采用基因芯片技术分别检测其circRNA表达谱,并进行组间比较与分析,以明确差异表达的circRNA,根据差异倍数选取差异最为显著的10个circRNA,采用定量RT-PCR (quantitative reverse transcription PCR,RT-qPCR)方法验证其在50对PTC患者及正常人全血中的表达情况。采用Arraystar公司circRNA靶基因分析软件,预测可能与上/下调明显的circRNA相互作用的靶miRNA分子。结果与癌旁组织相比,甲状腺乳头状癌组织的circRNA表达谱存在明显差异。在表达差异最显著的10个circRNAs中,其表达上调或下调的差异倍数均超过2.5倍(3个上调,7个下调),经RT-qPCR验证结果显示,与癌旁组织相比,甲状腺乳头癌组织中hsacircRNA074595表达上调3. 91±0. 13倍(P=0. 045),hsacircRNA100778下调3. 61±0. 05(P=0. 007),hsacircRNA104348下调4. 47±0. 17倍(P=0. 003);circRNA靶基因分析软件预测结果提示:miR-3944、-4435、-3467、-146、-92、-519和-301可能是hsacircRNA074595、100778和104348的潜在靶基因。结论 circRNA芯片可用于筛选甲状腺乳头状癌组织中差异表达的circRNA,与癌旁组织相比,多种circRNA在甲状腺乳头状癌组织中呈异常表达,这些circRNA及其潜在的靶基因可能与甲状腺乳头状癌的发生发展密切相关。

• 单位
  哈尔滨医科大学附属第四医院; 哈尔滨医科大学; 哈尔滨医科大学大庆校区