骨肉瘤中EMT相关基因的来源及与患者生存预后的关系分析

作者：彭银虓; 余彬^*; 秦辉; 薛力; 梁益建

来源：国际检验医学杂志, 2020, 41(18): 2239-2243.

• 骨肉瘤
• 上皮间质转化
• 免疫活性
• 基质细胞
• 肿瘤纯度

目的研究骨肉瘤中上皮间质转化(EMT)相关基因的来源及与患者生存预后的关系。方法从Gene Expression Omnibus数据库中获得3个独立的微阵列数据集(GSE36001、GSE39055和GSE16091)。GSE39055和GSE16091用于探讨骨肉瘤EMT、免疫活性、基质活性和肿瘤纯度间的相关性;GSE39055的总生存率和无病生存率数据用于生存分析。通过GSE36001和该院5例骨肉瘤标本、5例基质标本验证骨肉瘤中EMT相关基因表达的关键来源。结果 GSE39055和GSE16091中,EMT评分与免疫评分、基质评分均呈正相关(P<0.05),与肿瘤纯度均呈负相关(P<0.05);肿瘤纯度与免疫评分、基质评分均呈负相关(P<0.05)。GSE39055中,高EMT评分是骨肉瘤患者总生存率、无病生存率下降的危险因素(HR=4.977,P=0.003;HR=4.308,P=0.010)。GSE36001中,骨肉瘤标本EMT相关基因表达水平高于基质细胞基因(P<0.05);骨肉瘤标本和基质标本之间EMT相关基因的倍数变化(FC)高于基质细胞基因(P<0.05)。该院5例骨肉瘤标本中EMT相关基因表达水平高于基质细胞基因(P<0.05);5例基质标本中基质细胞基因表达水平高于EMT相关基因(P<0.05);骨肉瘤标本和基质标本之间EMT相关基因的FC高于基质细胞基因(P<0.05)。结论骨肉瘤中EMT、免疫活性、基质活性和肿瘤纯度之间存在相关性;EMT相关基因的表达与骨肉瘤患者的生存预后密切相关;基质细胞是骨肉瘤中EMT相关基因表达的关键来源。

• 单位
  成都市第三人民医院