青海省西宁市二审程序非法证据排除规则适用中存在的主要问题在于排除申请超出法定救济范围、审判人员面临多重压力、对证据的排除保守和谨慎。应该在制度层面改变实践中救济范围扩大问题、减轻外部因素的影响、提高审判人员的素质。