猪源副流感病毒5型SH毒株全基因组测序及分析

作者：姜宁; 郭禹汐; 李春秋; 苏明俊; 孔凡志; 孙东波^*

来源：中国生物制品学杂志, 2021, 34(09): 1033-1038.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.003418

• 副流感病毒5型
• 全基因组
• 遗传进化分析

目的对猪源副流感病毒5型(parainfluenza virus 5,PIV5)SH毒株进行全基因组测序及分析。方法根据GenBank中登录的猪源PIV5基因组序列设计10对引物,采用RT-PCR法对各片段进行扩增、测序,并对获得的PIV5-SH株全基因组序列进行遗传进化性分析。结果 PIV5-SH毒株基因组长15 246 nt,与传统毒株PIV5-W3A核苷酸序列同源性为98.7%。基于全基因组构建的遗传进化树显示,PIV5-SH毒株与韩国犬源PIV5(1168-1)、中国孟加拉虎源PIV5(PIV5-HMZ)、中国东北虎源PIV5(PIV5-SR)及中国小熊猫源PIV5(ZJQ-221)具有较近的亲缘关系,与传统毒株W3A亲缘关系较远。进一步以PIV5 NP、F及HN基因构建遗传进化树显示,PIV5-SH毒株与PIV5 1168-1、PIV5-HMZ、PIV5-SR、PIV5 ZIQ-221和PIV5-CAN毒株亲缘关系近。结论 PIV5不同分离株基因差异较小,表现出一定的遗传稳定性。

• 单位
  黑龙江八一农垦大学; 动物科技学院