结核分枝杆菌TB10.4蛋白的生物信息学分析

作者：高灿; 赵晓彤; 程江^*

来源：医学信息(上旬刊), 2023, 36(18): 1-7.

• 结核分枝杆菌
• ESAT-6蛋白
• TB10.4蛋白
• 生物信息学分析

目的 预测分析结核分枝杆菌Rv0288基因的编码蛋白TB10.4的结构和功能。方法 采用生物信息学软件ORF Finder、ExPASy、PSORT、SOSUI、TMHMM、SOPMA等预测分析结核分枝杆菌TB10.4蛋白的结构和功能。结果 TB10.4蛋白由96个氨基酸组成，分子式为C448H677N125O143S9，原子总数1402，编码基因全长291 bp，等电点4.58，不稳定性50.36，为不稳定性蛋白。ProtScale软件预测TB10.4蛋白的脂肪族氨基酸指数为59.38，平均疏水性-0.266。SOSUI和Signal IP软件预测该蛋白无信号肽无跨膜区。TMHMM、NerNGlyc、NetPhos软件预测TB10.4蛋白为可溶性蛋白，有8个磷酸化位点，无糖基化位点。TB10.4蛋白的二级结构以α-螺旋（86.46%）为主，亚细胞定位于细胞质。IEDB软件预测该蛋白有3个B细胞抗原表位；SYFPEITHI、RANKPEP、NetMHC软件预测该蛋白有多个CTL表位和Th表位。STRING预测TB10.4和esxS、esxB、esxH、esxG、PPE4、PPE 18、PE5等蛋白有相互作用，参与多种胞浆蛋白，其二级结构生物学过程。结论 TB10.4蛋白为不稳定疏水性以α-螺旋结构为主，含有多个T、B细胞抗原位点，能够磷酸化并与多种蛋白相互作用，可作为抗结核疫苗的候选蛋白。

• 单位
  石河子大学医学院第一附属医院; 石河子大学