胃癌脂代谢通路基因表达的转录组学高通量分析

作者：向丽娟; 汪圣毅; 包楚阳; 张焱; 韩坤; 刘虎^*

来源：安徽医科大学学报, 2019, 54(01): 5-9.

DOI：10.19405/j.cnki.issn1000-1492.2019.01.002

• 胃肿瘤
• 转录组测序
• 脂代谢
• 关键基因

目的探讨胃癌(GC)脂代谢(LM)通路的基因表达情况。方法转录组测序筛选8例GC及4例癌旁组织之间的差异表达基因,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析GC脂代谢相关通路中的关键基因(KGS)。结果高通量测序获得3 198个长度大于200 bp的差异表达基因。KEGG富集分析发现6个显著富集代谢通路,其中脂肪消化与吸收代谢通路有9个基因(MOGAT3、FABP2、FABP1、APOA4、NPC1L1、PLA2G2A、ABCG5、PLA2G4A、PLA2G12B)显著上调,2个基因(LIPF、PLA2G1B)显著下调。结论 GC脂代谢关键基因表达的异常状态为寻求胃癌诊断标志物提供了线索。

• 单位
  安徽医科大学第一附属医院; 北京诺禾致源科技股份有限公司; 安徽省肿瘤医院; 中国科学技术大学