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摘要
目的 基于系统生物信息学分析鼻咽癌样本基因芯片数据，筛选鼻咽癌的潜在预测基因，并对其进行实验验证。方法 通过基因表达综合数据库筛选鼻咽癌数据集，通过limma包进行差异分析，加权基因共表达网络包进行加权基因共表达网络分析，绘制韦恩图寻找共同基因，进行基因本体富集分析及京都基因与基因组百科全书通路分析。通过蛋白质互作网络、LASSO回归及非参数检验，进一步挖掘鼻咽癌的生物标志物。通过实时荧光定量PCR和Western blot对鼻咽癌关键预测基因的mRNA及蛋白表达情况进行检测，验证结果。结果 GSE12452数据集上调基因共622个，下调基因共351个，通过limma分析及加权基因共表达网络分析并交集最终获取116个交集基因，通过富集分析，生物过程主要包括细胞增殖及调控、细胞间黏附的调节等，富集于Rap1信号通路、Ras信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等通路，经过筛选得到血管生成素2(ANGPT2)、双氧化酶2(DUOX2)、人组织因子Ⅲ(F3)、白细胞介素-15(IL-15)、脂质运载蛋白2、视黄酸受体相关孤儿受体B(RORB)共6个关键基因，实时荧光定量PCR和Western blot实验证明ANGPT2、IL-15的mRNA和蛋白在鼻咽癌细胞中高表达，DUOX2、F3、RORB的mRNA和蛋白低表达。结论 ANGPT2、DUOX2、F3、IL-15、RORB为鼻咽癌的潜在预测分子标志物和治疗靶点，其机制可能与Rap1、Ras、肿瘤坏死因子等信号通路有关。
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