中国人群Hedgehog通路基因与非综合征型唇腭裂的亲源效应

作者：李文咏; 王梦莹; 周仁; 王斯悦; 郑鸿尘; 朱洪平; 周治波; 吴涛; 王红; 石冰

来源：北京大学学报(医学版), 2019, 52(05): 809-814.

• 亲源效应
• 非综合征型唇腭裂
• HH通路基因

目的:探索非综合征型唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)这一类常见出生缺陷的可能致病机制,在Hedgehog(HH)通路基因中(PTCH1、PTCH2、SHH、SMO)探索基因多态性对NSCL/P的关联关系以及亲源效应(parent-of-origin effects,Po O)对NSCL/P发病风险的影响。方法:纳入806个中国非综合征型唇腭裂核心家系,对HH通路基因(PTCH1、PTCH2、SHH、SMO)的83个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)进行传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT),并采用对数线性模型进行亲源效应分析。家系样本来自"唇腭裂基因和交互作用的国际合作研究"项目。采用Plink进行TDT检验;通过R软件中的Haplin v6. 2. 1软件包开展亲源效应分析。采用Bonferroni法进行多重检验校正。结果:经过质量控制,共纳入65个SNPs进行分析,Bonferroni显著性水平为7. 7×10-4(0. 05/65)。未校正P值前,关联分析发现rs4448343与NSCL/P存在关联(P=0. 023),6个单体型(rs10512249-rs4448343、rs1461208-rs7786445、rs10512249-rs4448343、rs16909865-rs10512249-rs4448343、rs1461208-rs7786445-rs12698335、rs288756-rs288758-rs1151790)与NSCL/P存在关联(P <0. 05); 6个单体型(rs288765-rs1233563、rs12537550-rs11765352、rs872723-rs288765-rs1233563、rs288765-rs1233563-rs288756、rs6459952-rs12537550-rs11765352、rs12537550-rs11765352-rs6971211)具有潜在的Po O效应(P <0. 05)。以上结果经过多重检验校正,均无统计学意义(P> 7. 7×10-4)。结论:未发现HH通路基因多态性与NSCL/P的关联,未发现HH通路基因通过Po O效应影响NSCL/P发病风险。

• 单位
  四川大学华西口腔医学院; 公共卫生学院; 北京大学; 口腔疾病研究国家重点实验室