毛木耳发酵料堆细菌群落多样性分析

作者：袁滨; 黄艺宁; 连燕萍; 柯丽娜; 吴振强; 邓优锦^*

来源：热带农业科学, 2023, 43(09): 45-52.

• 毛木耳
• 发酵料
• 16S rDNA扩增子测序

为了探究毛木耳培养料发酵过程中，微生物群落的多样性变化以及各时期标记物种，为揭示发酵机制提供依据，从而为筛选发酵过程的有益细菌提供参考。将栽培毛木耳的发酵培养料混匀建堆，自然发酵，发酵周期35d，从初始开始，每次翻堆前采用5点取样法取5个平行样本，一共5组25个样本；对样本进行16S rDNA扩增子建库及测序，并进行数据分析。结果表明：毛木耳发酵堆中的微生物多样性丰富，每个时期的OTU样本，数目分别为2807、2271、2553、2465和2106个，建堆期最多，第4次翻堆最少；PCA分析结果显示，同一时期的样本聚集，不同时期的样本分开；UPGM聚类显示，每个时期的不同重复在同一个分支内，每个时期形成独立分支。根据丰度的占比，在属水平，发酵堆中的菌群演化规律为尿素芽孢杆菌属从发酵初期到发酵完成，相对丰度依次为0.53%,18.51%,20.31%,37.10%和40.85%；嗜热共生杆菌属相对丰度依次为2.90%,4.69%,6.88%,7.22%和18.27%，占比逐渐提高；嗜热双孢菌属Thermobispora与己酸菌属Caproiciproducens在D0期的相对丰度分别为14.55%与13.42%，发酵一个月后下降为1.82%与0.08%。随着发酵的进行，微生物的α多样性呈下降趋势，局部在第二次翻堆有反弹；PCA及UPGM聚类能将各个时期发酵堆有效分开；在属水平，发酵堆的微生物群落从建堆期的嗜热双孢菌属Thermobispora与己酸菌属Caproiciproducens演变成发酵成熟期的尿素芽孢杆菌属Ureibacillus与嗜热共生杆菌Symbiobacterium。

• 单位
  漳州职业技术学院; 福建农林大学