血清外泌体中长链RNA作为早期肾癌诊断标志物的研究

作者：陈继胜; 吴巧; 杨安桥; 谢伟建; 卢大儒^*

来源：现代生物医学进展, 2021, 21(12): 2201-2206.

DOI：10.13241/j.cnki.pmb.2021.12.001

• 外泌体
• 肿瘤标志物
• 早期诊断
• LASSO回归
• 肾癌

目的:肾癌早期无明显症状,且无血清诊断标志物,晚期缺乏有效治疗手段。外泌体的生物学功能及现有研究报道为早期肾癌的诊断提供了新的理论基础和新思路,本文旨在尝试在肾癌血清外泌体中寻找肾癌诊断标志物以有助于提高肾癌的诊断水平,减少肾癌死亡率。方法:取肾癌肿瘤组和对照组各10个样本,用试剂盒(PEG法)分离外泌体,提取RNA后建库测序,数据处理后以|log2(fold change)|>1和显著水平qvalue<0.001为标准筛选得一组显著差异基因,设计引物探针后大样本qPCR验证,对数据进行统计并作t检验分析,通过LASSO回归建立诊断模型,ROC-AUC判断诊断价值。结果:RNA-seq并深度分析筛出PFN2RAB4B PHEX DACH1 Linc01765五个基因,运用LASSO回归建立了早期肾癌诊断模型,计算ROC-AUC值是0.818。结论:在肾癌血清外泌体中筛到一组基因,通过LASSO回归建立早期肾癌诊断模型,ROC-AUC值达0.818,具有一定的临床应用价值。

• 单位
  生命科学学院; 复旦大学