水稻稻曲病菌PCR快速检测技术及应用

作者:曾蓉; 徐丽慧; 吴雁; 高士刚; 刘欣; 戴富明*
来源:上海农业学报, 2018, 34(06): 23-26.
DOI:10.15955/j.issn1000-3924.2018.06.05

摘要

根据NCBI Gen Bank中已登记的水稻稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的全基因组序列,通过对生物信息学方法获得特异性基因,并根据核苷酸序列设计特异性引物。获得的检测引物UV-788F/UV-788R对所有水稻稻曲病菌具有很好的特异性,通过优化退火温度等反应体系,可稳定扩增出788 bp的目的片段,而其他参考菌株及健康种子均无条带。建立的检测方法对菌株基因组DNA的灵敏度为2 pg/μL。对测试样品基因组DNA扩增结果表明:受检的水稻种子检测到水稻稻曲病菌。研究建立的水稻稻曲病病菌的定性检测方法可实现对菌株的分子鉴定和种子的快速检测。

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