摘要
目的 利用生物信息技术探索白细胞介素-17(IL-17)在食管鳞癌中的作用。方法 采用文献计量学方法收集食管鳞癌关于IL-17的相关基础研究,获取相关研究中与之相关的细胞因子;利用人类肿瘤相关基因表达综合数据库(GEO)中的食管鳞癌芯片表达数据对筛选出的关键基因表达情况进行研究。取不同分期食管鳞癌肿瘤与组织标本检测IL-17及相关细胞因子表达情况。结果 搜索数据库,符合纳入标准文献有14篇,其中与IL-17相关的细胞因子有白细胞介素-6(IL-6)、S100钙结合蛋白A8(S100A8)、S100钙结合蛋白A9(S100A9)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)、基质金属蛋白酶13(MMP-13),利用RStudio分析GEO数据库中的GSE26886数据集,结果显示IL-17在肿瘤组织中表达量较正常组织高,且其中能够影响IL-17分泌的细胞因子IL-6的表达量也高于正常组织;在IL-17影响的下游因子中S100A8、MMP-9、MMP-13也表现类似结果,但是肿瘤组织中S100A9表达量低于正常组织。免疫组化检测食管鳞癌组织标本结果显示肿瘤组织中IL-17表达量较正常组织表达增加,选取热度较高的MMP-9、IL-6、S100A9行蛋白质免疫印迹,得出结果和GEO提取结果类似。结论 利用GEO数据库检测结果与实践结果类似,可以使用信息技术提取相关结果,进而与临床结合,可以使临床更高效达到研究目的。
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