钩藤光敏色素互作因子鉴定及其表达分析

作者：王晓红; 郑浩杰; 李雪; 强玮; 于晓松; 上官黎阳; 张明生^*

来源：植物生理学报, 2021, 57(11): 2104-2116.

DOI：10.13592/j.cnki.ppj.2021.0188

• 钩藤
• 光敏色素互作因子
• 遮光
• 系统进化分析
• 基因表达

光敏色素互作因子(phytochrome-interacting factors, PIFs)是具有基本螺旋-环-螺旋(bHLH)结构域的转录因子,它们与光敏色素相互作用,在光信号转导过程发挥重要作用。基于转录组数据注释及蛋白同源比对,共筛选出28个钩藤PIF家族成员(UrPIFs),编码蛋白的长度在420～741个氨基酸之间,理论分子量46.47～79.46 kDa;等电点5.97～9.15。亚细胞定位预测结果显示UrPIFs均位于细胞核。系统进化关系和保守基序分析表明, 28个UrPIFs分为4组,都具有活性光敏色素B结合(active phytochrome B-binding, APB)结构域和bHLH结构域,而且每组成员之间具有相似的保守基序。组织表达谱显示多数UrPIFs在叶中表达量较高,其次是茎,最低的是根。在遮光条件下,除UrPIF05外, 7个UrPIFs表达量呈上升趋势;转移至正常光照条件后, 8个Ur PIFs的表达量均呈下降趋势。尤其是UrPIF15对光较为敏感,可能在光信号转导中发挥重要作用。UrPIFs的鉴定和分析可为进一步构建钩藤光调控网络提供参考。

• 单位
  贵州大学; 生命科学学院; 贵州省农业科学院