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摘要
目的 基于生物信息学分析构建系统性硬化症（SSc）潜在的微RNA (miRNA)-mRNA调控网络。方法 使用GEO2R工具对基因表达图谱（GEO）数据库进行分析，筛选出SSc患者和正常健康者之间的差异表达miRNA (DEM)。通过miRNet网站检索DEM靶基因，FunRich软件分析靶基因的转录因子，利用DAVID在线分析工具对靶标基因进行基因本体（GO）注释和京都基因与基因组数据库（KEGG）通路富集分析。STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和DEM-Hub基因调控网络，利用GSE146093数据集评估和验证Hub基因的表达。结果 筛选出26个DEM，其中2个上调，24个下调。共检索出5 450个靶基因，这些靶基因主要富集于P53信号通路、FOXO信号通路、DNA转录和细胞间黏附等，借助FunRich分析发现SP1和YY1为这些靶基因的主要转录因子。通过构建DEM-Hub基因网络发现，大部分Hub基因可能受到miR-455-3p、let-7e-5p和miR-149-5p的调控。GSE146093数据集中UTP15、PTBP1的表达一致。因此推测let-7e-5p-UTP15、miR-4440-PTBP1是潜在的调控靶点。结论 构建了SSc潜在的miRNA-mRNA调控网络，即let-7e-5p-UTP15、miR-4440-PTBP1是潜在的调控靶点。
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单位南阳理工学院
