基因加倍对棉花线粒体atpA基因RNA编辑率的影响

作者：张晓; 李才华; 王婧; 张兰兰; 牟晓雨; 王昕玥; 甘刘美; 周鹏展; 张锐^*

来源：生物技术进展, 2022, 12(05): 737-745.

DOI：10.19586/j.2095-2341.2022.0041

• 棉花
• 线粒体基因组
• atpA
• 基因加倍
• RNA编辑

植物线粒体基因组中存在RNA编辑（C-U）现象，且有完全编辑和部分编辑之分。棉花细胞质雄性不育（cytoplasmic male sterile,CMS）系和保持系线粒体基因组中atpA基因各有两个拷贝，存在基因加倍现象，但atpA基因加倍对其RNA编辑率的影响尚不清楚。通过Southern blot、染色体步移技术确定出该基因每个拷贝具体的DNA序列，发现一个拷贝是完整的，一个拷贝是截短的。用RT-PCR、环化RT-PCR方法扩增出每个拷贝相应的cDNA，结果表明：棉花CMS系和保持系atpA基因完整拷贝和截短型拷贝都转录。完整拷贝、截短型拷贝中分别存在6、4个RNA编辑位点。完整拷贝6个RNA编辑位点在保持系中的编辑率都是100%；在CMS系中编辑率分别是100%、85%、100%、92%、100%、100%。截短型拷贝4个位点在保持系中的编辑率分别是55%、37%、55%、27%；在CMS系中编辑率分别是100%、90%、100%、100%。据此推测截短型拷贝在保持系中承受选择压较小，很可能已失去功能；而在CMS系中仍承受较大选择压，很可能具有新的功能。

• 单位
  长春理工大学; 中国农业科学院生物技术研究所; 生命科学技术学院