共表达网络鉴定食管鳞癌中抗肿瘤细胞毒性分子

作者：李孟祥; 陈攀; 杜玉博; 张自超; 孙魁; 冯笑山; 高社干; 齐义军^*

来源：食管疾病, 2023, 5(01): 11-18.

DOI：10.15926/j.cnki.issn2096-7381.2023.01.003

• 食管鳞癌
• 基因共表达网络
• 免疫细胞毒性

目的 鉴定新的抗食管鳞癌(ESCC)免疫细胞毒性相关分子。方法 基于ESCC转录组表达谱数据，利用CIBERSORT反卷积算法计算ESCC样本中免疫细胞构成比；通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建基因模块；计算免疫细胞构成比与细胞毒性基因、共表达网络模块的相关性，确定关键模块。通过基因的模块隶属度、基因显著性和预后相关性，鉴定关键基因。结果 WGCNA方法共构建30个基因模块，其中white模块包含了本研究纳入的所有细胞毒性相关基因(GZMA、PRF1、GZMB和IFNG),将其作为关键模块。关键模块共包含18个关键hub基因，其中8个基因表达异常与ESCC患者预后相关。结论 通过基因共表达网络方法，鉴定到8个ESCC细胞毒性相关基因。

• 单位
  河南科技大学第一附属医院; 洛阳理工学院