大柴胡汤治疗肝细胞癌lncRNA-miRNA-mRNA转录网络整合分析

作者：郑飘; 陈博威; 宁迪敏; 肖唯; 田雪飞^*

来源：中国中医药信息杂志, 2021, 28(12): 22-29.

DOI：10.19879/j.cnki.1005-5304.202104055

• 肝细胞癌
• 大柴胡汤
• 转录网络
• 生物信息学
• 网络药理学
• 分子对接

目的挖掘大柴胡汤治疗肝细胞癌的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,探讨其抗肝癌作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GEO、miRDB、mi RTarBase、TargetScan数据库获取大柴胡汤的活性成分、预测靶点及肝细胞癌的差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)、微小RNA(mi RNAs)和m RNAs,通过R语言和Perl软件筛选大柴胡汤治疗肝细胞癌的关键lncRNAs、mi RNAs、m RNAs。采用Cytoscape3.7.0软件和STRING数据库构建活性成分-靶点网络、lncRNA-miRNA-mRNA转录网络和蛋白相互作用网络,进行GO和KEGG富集分析,并予分子对接验证,进行整合分析。结果得到大柴胡汤治疗肝细胞癌的97个有效成分和42个靶点,构建了由19个关键lncRNAs、23个关键mi RNAs和42个关键m RNAs组成的lncRNA-miRNA-mRNA转录网络。富集分析结果显示,这些靶基因参与了肿瘤的生存、凋亡、自噬、氧化应激、蛋白激酶等生物学过程,主要通过PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和TNF信号通路等发挥作用。结论大柴胡汤治疗肝细胞癌具有多成分、多靶点、多途径协同作用特点,可为相关研究提供依据和方向。

• 单位
  湖南中医药大学; 中南大学湘雅医院; 湖南中医药大学第一附属医院