2019-2022年南京市急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒分子流行病学分析

作者：陶璐秋; 王璇; 余艳; 葛藤; 龚红瑾; 雍玮; 丁洁^*

来源：病毒学报, 2023, 39(05): 1272-1284.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004393

• 诺如病毒
• 暴发
• 急性胃肠炎
• 基因型

诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要病原体之一，本研究通过分析2019-2022年南京市诺如病毒急性胃肠炎暴发的流行特征和主要基因型变化，为疫情防控提供依据。收集2019年9月至2022年8月南京市疑似诺如病毒急性胃肠炎暴发样本，通过荧光定量PCR和一步法RT-PCR检测，对阳性样本进行序列测定并分型，挑选48株南京代表株与国内外参考株进行同源性分析。2019-2022年南京市诺如病毒急性胃肠炎暴发的高峰为冬春季，场所主要分布在小学和幼儿园，暴发以诺如病毒GII为主，共检测到11种基因型，包括4种GI和7种GII。主要流行株在三个流行季间有所变化，GII.2[P16]为2019-2021年的优势流行株，2021/2022流行季中GII.4 Sydney 2012[P16]亚型、GII.17[P17]亚型占比最大，多种亚型毒株共存。同源分析发现，2021年2株GII.6[P7]南京株分属于两类不同来源的GII.6衣壳基因型，2019-2022年的GII.2[P16]和GII.4 Sydney 2012[P16]南京株的部分聚合酶区序列变化较衣壳蛋白区大。2019-2022年间南京市诺如病毒急性胃肠炎暴发数量呈上升趋势，并且主要流行基因型发生改变。

• 单位
  南京医科大学; 南京市疾病预防控制中心