鲍曼不动杆菌噬菌体SWH-Ab-3的生物学特性及其全基因组初步研究

作者：张然; 罗娟^*; 吴柳; 杨竹兰; 罗希; 张波

来源：第三军医大学学报, 2019, 41(13): 1192-1199.

DOI：10.16016/j.1000-5404.201902048

• 鲍曼不动杆菌
• 噬菌体
• 生物学特性
• 全基因组分析

目的从医院污水中分离鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体,探讨其生物学特性及基因组基本信息。方法以临床分离的鲍曼不动杆菌为指示菌,采用双层琼脂平板法分离、纯化噬菌体,观察噬菌斑特征;利用透射电子显微镜观察噬菌体的形态特征;采用点板试验测定噬菌体的裂菌谱,并观察其最佳感染复数(MOI)、一步生长曲线以及对热、酸碱等理化因素的耐受性。提取噬菌体全基因组DNA,采用Illumina Hiseq2000高通量测序,并对其基因组序列进行注释、比对分析。结果从污水中成功分离出1株鲍曼不动杆菌的裂解性噬菌体,命名为SWH-Ab-3;噬菌体头部直径约为70 nm,尾长约80 nm,初步判断其属肌尾噬菌体科;该噬菌体裂菌谱较窄(6株/42株),最佳感染复数为0.1,潜伏期为40 min,爆发期为50 min,裂解量为31.4 PFU/cell,对热和酸碱环境的耐受性较高。SWH-Ab-3基因组长度为41 730 bp,G+C%含量为39.38%,共编码53个ORF(33个已知功能基因,20个假想蛋白),其序列与Abp1和vBAbaPB3的同源性最高(≥94.0%),但基因组长度、G+C%含量和形态特征差异显著。结论 SWH-Ab-3为1株新分离的鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体,属肌尾噬菌体科,对热、酸碱等理化因素较耐受,可能通过穿孔素和裂解酶组成的"二元裂解系统"发挥裂菌作用,裂解能力较强,但裂菌谱较窄。

• 单位
  第三军医大学; 中国人民解放军陆军军医大学; 南昌大学医学院