茅苍术的全长转录组分析

作者：周竹青; 林敏; 梅之南; 熊慧^*

来源：中南民族大学学报(自然科学版), 2023, 42(03): 319-326.

DOI：10.20056/j.cnki.ZNMDZK.20230305

• 茅苍术
• 全长转录组
• 功能注释

为探究茅苍术Atractylodes lancea (Thunb.) DC.中药用活性成分生物合成的遗传基础，对茅苍术进行三代全长转录组测序，通过生物学信息学分析，构建了茅苍术全长转录本数据库.共获得26238条平均长度为1360 bp的全长转录本，其中25413条（96.86%）在NR、KEGG、GO、KOG和Swiss-Prot 5个数据库中得到注释.根据NR比对结果，茅苍术与菊科菜蓟属刺苞菜蓟（Cynara cardunculus）最为相似；根据GO注释分析，8371条转录本注释到生物学过程、分子功能和细胞组成的三大类共48条GO条目；有15848条转录本注释到KOG数据库，参与基本功能预测序列数目最多，为2598条；在KEGG注释分析中，共有12137条转录本被注释到130条代谢通路；基因结构分析中，得到325条LncRNA、24723条CDS序列，检测到SSR位点8027个；根据转录因子分析，共预测到81个TF家族，包括1830个转录因子.该研究获得了茅苍术的全长转录组数据库，并为后续开展苍术的育种、活性成分的生物合成机制以及遗传多样性等分子研究提供宝贵的遗传资源.

• 单位
  中南民族大学; 华中农业大学