摘要
为进一步丰富紫花槭基因资源,揭示紫花槭叶片表皮毛疏密程度的分子机理,本实验采用高通量测序技术对紫花槭叶片表皮毛稀疏和浓密两种材料(WM和TM)进行转录组测序分析,获得32 845条unigene序列,并在数据库中注释了20 698条。在NR数据库中,匹配物种信息最多的是甜橙(3 948条, 19.54%)。紫花槭叶片unigene经KOG数据库分为25个功能类别,主要集中在一般功能预测、信号传导机制以及翻译后修饰、蛋白质周转、分子伴侣。对紫花槭两种叶片材料进行差异基因筛选,得到2 945个差异基因,其中上调基因1 373个,下调基因1 572个。运用MISA程序搜索SSR标记,共获得13 173个SSR位点,出现频率为0.401,其长度主要集中在10~15 bp (6 518个, 49.48%)。紫花槭SSR位点共有170种重复基元,其中重复基元数量最多的是单碱基(5 901个, 44.80%)。在unigene库中共发现202 147个SNP位点,发生频率为1/153 bp,其中碱基转换位点数量(130 538个, 61.56%)显著高于颠换位点(81 509个, 38.44%)。研究结果为紫花槭叶表皮基因调控及分子辅助育种提供基础数据。
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