马氏珠母贝V-ATPase-d基因序列特征及其与耐低温性状的关系

作者：赖卓欣; 宋欣霖; 潘若哲; 谭又瑄; 王庆恒

来源：水产学报, 2022, 1-13.

• 马氏珠母贝
• Pm-V-ATPase-d
• SNP
• 低温

V-ATPase在生物应对各种环境压力时发挥重要功能，为了探究V-ATPase在马氏珠母贝低温适应过程中的作用，本研究克隆了马氏珠母贝的V-ATPase-d基因，采用qRT-PCR技术研究了低温胁迫下Pm-V-ATPase-d表达量的变化，并筛选和比较分析了该基因在耐低温选育系（low temperature resistant line， R） F3和北部湾野生群体（Beibu Gulf wild population， W）外显子区的SNP位点。结果显示，Pm-V-ATPase-d总长为1 473 bp，开放阅读框（ORF）为1 140 bp，编码379个氨基酸，具有ATP典型的结构域Pfam vATP-synt＿AC39。Motif分析及三级结构预测结果表明，Pm-V-ATPase-d具有较高的保守性，其在系统进化树中与太平洋牡蛎聚为一支。组织荧光定量结果显示，Pm-V-ATPase-d在所检测的组织中均有表达，在肝胰腺、性腺和鳃组织表达量较高；在低温胁迫条件下，Pm-V-ATPase-d基因的表达量随着时间的延长呈现先上升后下降的趋势，且低温组的表达量在5 d内均显著高于对照组，这表明Pm-V-ATPase-d可能参与了马氏珠母贝对温度胁迫的响应；对Pm-V-ATPase-d外显子区的SNP分析共得到35个SNP，其中34个为同义突变，只有一个位点为非同义突变，26个SNP在W和R群体的不同基因型和等位基因之间具有显著差异，单倍型连锁不平衡分析结果显示，Pm-V-ATPase-d基因SNPs可形成6个单倍体块，14种单倍型，其中单倍型GAAT、CGC、TC、TG、AG与马氏珠母贝耐低温性状显著相关。研究表明，Pm-V-ATPase-d可能是参与调节马氏珠母贝低温适应过程中的候选基因，本研究可为马氏珠母贝对低温的适应机制提供研究基础，筛选出的与抗低温性状相关的 SNPs 及单倍型可应用于分子辅助育种。

• 单位
  广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室; 广东海洋大学