妊娠期糖尿病相关差异表达基因的生物信息学分析

作者：王雪春; 徐榕莉^*; 郑秀琼

来源：福建医药杂志, 2022, 44(02): 6-10.

• 妊娠期糖尿病
• 差异基因
• 生物信息学

目的 探讨妊娠期糖尿病（GDM）表达差异基因的功能及信号通路生物信息学分析。方法 从GEO数据库下载基因芯片数据（GSE65737,GSE70493和GSE92772），用R语言软件Limma包，以P<0.05，|Log10FC|≥1或≥2标准筛选差异显著基因，并用ggplot包绘制图。应用基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）进行差异基因功能分析，并使用Cytoscape进行文献共线分析。结果 GSE65737,GSE70493和GSE92772分别筛选到588,3,445个差异显著基因。GSE70493与GSE92772筛选到48个共同的GO富集，主要富集于细胞体内平衡，细胞代谢，囊泡转运，免疫应激反应等。文献共线分析得到7个可能同GDM相关的候选基因。结论基因IL1B、ICAM1、NLRP3、CXCL10、SOCS3、IRF3、IRF7可能与GDM发病进展密切相关，为GDM靶向药物的开发提供潜在靶点。

• 单位
  福建省妇幼保健院