探索m6A相关lncRNAs预测胃腺癌患者总体生存率

作者：潘辉; 姚文霞; 梁敏; 周新科^*

来源：肿瘤预防与治疗, 2023, 36(05): 373-388.

• m6A
• lncRNAs
• 胃腺癌
• 预后
• 生物标志物

目的：胃腺癌是胃癌最常见的亚型。N6-甲基腺苷（N6-methyladenosine,m6A）和长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)在胃腺癌的预后价值中起着至关重要的作用。因此，辨别与m6A相关的lncRNA在胃腺癌研究中至关重要。方法：本研究从TCGA数据库中获取了胃腺癌研究的RNA序列转录组数据、相关临床信息。使用R语言的“limma”包对15 901个lncRNAs按肿瘤组织和正常组织分组进行差异表达分析。采用单因素Cox回归分析从TCGA数据集中的347个与m6A相关lncRNAs中筛选出与预后相关的基因67个（P <0.05）。使用R包“glmnet”对67个入选lncRNAs进行LASSO Cox回归分析，确定12个m6A相关的lncRNAs与胃腺癌患者的总生存期明显相关，并采用多因素Cox回归分析建立起m6A相关的lncRNAs风险评分模型。单因素和多因素回归分析结果表明风险评分模型是患者预后的独立影响因素（HR=3.45,95%CI为2.46～4.99,P <0.001）。分析风险评分与肿瘤免疫微环境细胞浸润的关系。最后，基于独立的预后影响因素（年龄、性别、风险评分、T分期、N分期）建立列线图。结果：确定12个m6A相关的lncRNAs与胃腺癌患者的总生存期明显相关，建立起m6A相关的lncRNAs风险评分模型。并证明该模型与肿瘤微环境细胞浸润存在相关性。基于独立的预后影响因素建立列线图，模型的C-index为0.73，模型预测有效性较高。结论：通过对lncRNAs风险模型的反复验证，证实了12个m6A相关lncRNAs可以作为胃腺癌患者风险预测的指标。

• 单位
  广州医科大学附属第五医院