基于复杂网络理论的PPI网络拓扑分析

作者：李敏; 陈建二; 王建新

来源：计算机工程与应用, 2008, 44(8): 20-22,44.

DOI：10.3778/j.issn.1002-8331.2008.08.006

• 生物信息学
• 蛋白质相互作用网络
• 复杂网络
• 网络拓扑

蛋白质相互作用在生命活动中起核心作用,由蛋白质相互作用构成的PPI网络的拓扑特性分析是后基因组时代最重要的研究课题之一.应用复杂网络理论对DIP数据库中7个物种的8个PPI网络的拓扑结构进行分析与研究.分析结果表明,这些PPI网络具有较小的平均路径长度和较高的聚集系数,其度分布服从幂规律,即p(k)=ak',其中r大于1小于3,a近似等于1±0.5,表现出典型的无标度性,并具有高的异质性.其中平均度大于3.5的5个PPI网络对随机删除不超过10%的顶点都具有很好的鲁棒性,但对有选择的删除2%的高度顶点就开始表现出极弱的抗攻击性.

• 单位
  中南大学