基于权重基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘双酚A代替物的分子作用机制

作者：周蕾; 吕钧慧; 王悦; 李培锋^*

来源：中国兽医学报, 2020, 40(04): 785-790.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.04.21

• BPA代替物
• 分子对接
• 权重基因共表达网络分析
• 蛋白互作网络
• 基因-疾病关联分析

评估双酚A(bisphenol A, BPA)代替物的内分泌干扰活性并挖掘其分子作用机理。采用分子对接技术模拟预测BPA代替物对人雌激素受体α(estrogen receptor,ERα)的结合活性;构建权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)找到BPA代替物和细胞增殖之间强相关的模块和基因;构建蛋白互作网络(protein protein interaction network,PPI),找到BPA代替物发挥雌激素活性的枢纽基因(Hub gene);基因-疾病关联(gene-disease associations)分析找到与BPA代替物高度相关的人类疾病。结果表明,6种BPA均具有雌激素活性;WGCNA分析找到2个模块共1 090个基因与细胞增殖强相关的基因;PPI挖掘到BPA代替物发挥雌激素作用的Hub gene是孕酮受体(rrogesterone receptor,PGR)、Myb相关蛋白(Myb-related protein like 1,MYBL1)、过氧化物酶体增殖剂激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor,PPAR)和MYB原癌基因转录因子(MYB);基因-疾病关联分析表明BPA代替物可能对机体的乳腺肿瘤、子宫内膜癌和糖尿病等疾病的发生发展过程产生不良影响。

• 单位
  内蒙古农业大学; 北京大学