马尾松候选基因EST-SSR引物开发

作者：龚桂芳; 冯源恒; 安琪; 杨章旗^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(23): 7840-7846.

DOI：10.13271/j.mpb.018.007840

• 马尾松(Pinus massoniana)
• 转录组
• SSR
• 关联分析
• 引物开发

松脂产量是马尾松的重要经济性状,通过开展候选基因关联分析获得与产脂性状具有较强相关性的遗传标记,进行分子标记辅助选择,是加快马尾松产脂性状改良进程的一种可行方法。该研究通过对马尾松高产脂无性系与普通产脂无性系的针叶、顶芽和韧皮部3个组织进行转录组差异分析,并根据所得差异序列开发SSR引物,为马尾松产脂性状候选基因关联分析研究提供分子标记。经分析共在6个样本的124 345条Unigene序列中发现14 461个SSR位点。根据表达差异基因序列含有SSR的位点设计开发了259对EST-SSR引物,其中147对引物可扩增出清晰条带,引物的有效性为56.76%;有65对引物表现出多态性,多态率为25.10%,可用于进行马尾松产脂性状候选基因关联分析。本研究所开发的EST-SSR引物为今后马尾松的关联分析研究、分子标记辅助育种研究等提供可靠的标记,并为马尾松产脂性状关键基因的挖掘提供参考依据。

• 单位
  广西师范大学; 广西壮族自治区林业科学研究院; 生命科学学院