桃花型（铃型/蔷薇型）性状相关SNP位点挖掘与候选基因分析

作者：孟歌; 朱更瑞; 方伟超; 陈昌文; 王新卫; 王力荣; 曹珂

来源：植物遗传资源学报, 2021, 1-9.

DOI：10.13430/j.cnki.jpgr.20210819003

• 观赏桃育种
• 重测序
• 单核苷酸多态性
• 候选基因

桃的花型分为铃型和蔷薇型，铃型花朵小且边缘卷曲，蔷薇型花朵大且完全展开，蔷薇型重瓣花是观赏桃育种时追求的主要性状之一。目前，与桃铃型/蔷薇型花型性状连锁的分子标记研究较少，限制了桃花型性状分子标记辅助育种进程。为了鉴定与桃花型关联的SNP（单核苷酸多态性位点）位点并挖掘候选基因，本研究通过对199份桃种质进行重测序，获得了1，042，687个SNP。采用一般线性模型对桃花型性状进行全基因组关联分析，获得7个与目标性状显著关联的位点，其中2个位于第2染色体，5个位于第8染色体。进而对第8染色体的3个SNP进行竞争性等位基因特异性PCR（kompetitive allele-specific PCR，KASP）分型，在5个F1群体进行了进一步的验证。χ2验证结果表明：Chr.8：14，484，624 bp与桃花型性状显著关联。5个F1群体基因型和表型的对应关系表明，Chr.8：14，484，624 bp准确率最高，为93.46%。组织特异表达结果显示，在上述定位区间内的6个注释基因中，Prupe.8G118100在花中特异表达，被认为是花型性状的候选基因。本研究鉴定了桃铃型/蔷薇型花型性状关联位点，并对候选基因进行了筛选，以上结果可进一步转化为分子标记，用于观赏桃分子标记辅助选择育种。

• 单位
  中国农业科学院郑州果树研究所