FOXI3在头颈部鳞状细胞癌中的表达及相关性分析

作者：潘志勇; 谢丽婷

来源：深圳中西医结合杂志, 2022, 32(09): 8-12.

DOI：10.16458/j.cnki.1007-0893.2022.09.003

• 头颈部鳞状细胞癌
• 叉头盒I3基因
• 生物信息学分析

目的：探究叉头盒I3基因(FOXI3)在头颈部鳞状细胞癌(HNSC)组织中的表达及其对HNSC患者预后的影响，阐明FOXI3在HNSC发生发展中的作用。方法：从肿瘤基因组图谱(TCGA)下载HNSC的基因表达数据和相应的临床信息。使用TIMER 2.0、GEPIA和UALCAN在线数据库验证FOXI3在HNSC中的表达。应用WilCoxon秩和检验分析FOXI3在非配对样本及配对样本中的表达差异。应用R软件ggplot2包分析TCGA数据集中FOXI3表达与HNSC临床因素之间的相关性。应用Cox回归分析TCGA数据库中具有预后信息的HNSC患者，Kaplan Meier数据库及GEPIA数据库验证上述结果。使用R软件进行单因素和多因素Cox分析。使用GeneMania及STRING数据库对FOXI3相互作用基因和蛋白质进行鉴定，同时应用R软件的clusterProfiler包对相互作用的基因进行富集分析。应用TIMER 2.0分析HNSC中FOXI3表达与癌症相关成纤维细胞的浸润水平的相关性。应用R软件GSVA包的ssGSEA算法估计TCGA数据库中HNSC患者FOXI3表达与免疫浸润之间的相关性。结果：FOXI3在HNSC中的表达显著高于正常组织，差异具有统计学意义(P<0.001)。FOXI3基因表达升高的HNSC患者总体生存率(OS)及疾病特异性生存期(DSS)较低表达组差，差异具有统计学意义(P<0.05)。单因素Cox回归显示FOXI3可作为独立的预后因素。GeneMania数据库及STRING数据库显示，与FOXI3相互关联的基因较多，富集分析显示其参与的细胞组分、分子功能、生物学过程及信号通路较复杂。基于MCPCOUNTER、TIDE、EPIC算法，HNSC的FOXI3表达与癌症相关成纤维细胞的浸润水平呈正相关。在HNSC中FOXI3与NK CD56bright细胞浸润水平呈正相关，而与多种免疫细胞的浸润水平呈负相关。结论：FOXI3在HNSC组织中的表达高于正常组织，且其高表达可能与HNSC的发生、发展及不良预后相关，FOXI3可作为HNSC诊断与预后的候选指标。

• 单位
  莆田学院附属医院