基于RNA-seq的无量山乌骨鸡 (Gallus gallus) 肝脏脂代谢相关miRNAs的筛选

作者：施艳燕; 段俊保^*; 欧正淼; 周杰珑; 陈粉粉

来源：基因组学与应用生物学, 2023, 1-13.

• 无量山乌骨鸡
• 肝组织
• 脂代谢
• miRNA

为研究无量山乌骨鸡 (Gallus gallus) 肝组织脂代谢相关miRNA (microRNA) 在不同发育阶段的表达特征，本研究采集出壳当日 (D1) 和第168日龄 (D168) 母鸡肝组织样品作为试验材料，利用DNBSEQ平台进行测序，DEGseq筛选差异表达的miRNA及其靶基因，随机选取9个差异表达miRNA进行RT-qPCR验证，KEGG通路分类筛选出脂代谢相关miRNA并进行聚类分析，预测脂代谢相关miRNA靶基因并进行GO和KEGG通路功能富集，构建脂代谢相关miRNA和靶基因关联网络。分析结果表明，筛选出106个差异表达miRNAs，包括54个上调和52个下调miRNA；聚类得到41个脂代谢相关的miRNAs；预测到38个靶基因，对靶基因的功能注释确定主要富集于甘油磷脂代谢、脂肪酸代谢和鞘脂代谢等脂质代谢相关通路，novel-gga-miR2311-5p-DGKZ、novel-gga-miR2047-3p-ACACA、novel-gga-miR866-3p-DGKH是脂代谢相关候选miRNA-mRNA关系对。研究提示：无量山乌骨鸡肝组织miRNA在不同发育阶段表达特征存在差异，研究结果为无量山乌骨鸡肝组织miRNA调控脂代谢的分子机制提供参考依据。

• 单位
  西南林业大学; 生命科学学院