黄淮麦区北片小麦穗部相关性状的全基因组关联分析

作者：张帅; 张希兰; 张娜; 赵明辉; 乔文臣; 孙丽静; 李辉; 傅晓艺; 何明琦; 纪军; 李俊明^*

来源：华北农学报, 2020, S1: 31-39.

• 小麦
• 黄淮麦区
• 穗部性状
• 全基因组关联分析
• 分子标记辅助选择育种

为了挖掘与穗部相关性状显著关联的标记位点及其优异等位变异,以黄淮麦区北片近30 a培育的132个小麦主栽品种及其衍生品系为材料,在8个环境中对穗长、总小穗数、穗粒数和穗密度等4个重要穗部相关性状进行表型鉴定,结合小麦55K SNP芯片基因分型开展标记-性状全基因组关联分析。结果表明,所检测到的121个与穗部相关性状显著关联的标记位点包括与穗长显著关联的位点38个,与总小穗数显著关联的位点15个,与穗密度显著相关的位点47个,与穗粒数显著关联的位点21个。其中,有8个显著关联位点在3个及3个以上环境中被重复检测到,包括与穗长显著关联位点AX-108730544-1D、AX-94755570-2A和AX-111703851-6D,与总小穗数显著关联的位点AX-111235532-2A和AX-110926142-2A,与穗粒数显著关联位点AX-110378404-5A,与穗密度显著关联位点AX-108730544-1D和AX-110963299-1D。对上述8个显著关联位点的地域分布进行分析,发现各个位点的优异等位基因频率在黄淮麦区不同省份品种中存在较大差异。基因聚合效应分析表明,穗长、总小穗数和穗密度表型值随优异等位基因数量增加而呈现提高的趋势。上述研究结果对小麦穗部性状优异等位基因挖掘和分子标记选择育种具有重要的参考价值。

• 单位
  中国科学院大学; 河北省农林科学院旱作农业研究所; 中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心; 河北省农林科学院粮油作物研究所; 石家庄市农林科学研究院