血清RP11-88E10.5对直肠癌患者新辅助放化疗疗效与预后预测价值分析

作者:许开宇; 赵爱民; 朱昱冰; 李稳霞; 于海蛟; 丁磊*
来源:中华肿瘤防治杂志, 2020, 27(11): 903-909.
DOI:10.16073/j.cnki.cjcpt.2020.11.10

摘要

目的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)广泛参与了结直肠癌的发生和发展。但目前关于局部进展期直肠癌对新辅助放化疗(neoadjuvant chemoradiotherapy,CRT)疗效的无创血清预测标志物的研究仍较少。本研究拟探讨血清RP11-88E10.5对CRT治疗局部进展期直肠癌疗效和预后的预测作用。方法回顾性选择2019-01-01-2019-01-14就诊首都医科大学附属北京世纪坛医院结直肠肿瘤外科的局部进展期直肠癌患者8例,于初治前搜集血清样本,根据其对CRT的疗效分为2组。对2组间的血清样本进行lncRNA测序,筛选差异表达lncRNA。从科室样本库中搜集2017-01-01-2018-12-31就诊的98例局部进展期直肠癌的初治血清标本进行验证,比较RP11-88E10.5高表达组与RP11-88E10.5低表达组对CRT的反应程度,并基于TCGA数据库分析RP11-88E10.5在直肠癌中的预后预测价值。最后通过生物信息学手段,预测RP11-88E10.5的靶基因,并对靶基因进行生物功能注释。结果对5例反应良好患者患者和3例反应不良患者的血清lncRNA测序结果进行比较,共筛选出688个差异lncRNA,其中在反应良好组上调lncRNA共548个,下调lncRNA共140个。筛选RP11-88E10.5(logFC=2.5,t=7.42,Q=0.001 498)进一步分析。从科室标本库中搜集98例直肠癌的血清标本进行低通量扩大反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)验证,根据Cutoff finder结果,以RP11-88E10.5相对表达值6.792为截点,分成高、低表达组,RP11-88E10.5高表达组的肿瘤反应率(25.0%,8/32)低于RP11-88E10.5低表达组(86.4%,57/66),χ2=36.334,P<0.001;病理完全缓解率(3.1%,1/32)低于RP11-88E10.5低表达组(21.2%,14/66),χ2=5.439,P=0.019。RP11-88E10.5预测CRT疗效的曲线下面积(area under curve,AUC)为0.79,具有较强的预测效能。TCGA数据库的预后分析结果提示,RP11-88E10.5低表达组的5年总生存率(64.3%)优于RP11-88E10.5高表达组(37.6%),差异有统计学意义,HR=2.4,P<0.001。生物信息学分析结果提示,RP11-88E10.5的功能主要富集于中性粒细胞脱颗粒、白细胞激活、免疫应答、免疫效应过程和细胞分泌过程等生物学过程中。结论血清RP11-88E10.5水平可预测CRT治疗局部进展期直肠癌的疗效,并与直肠癌不良预后相关。

  • 单位
    首都医科大学附属北京世纪坛医院