糖尿病肾病特异性肾小管间质纤维化相关基因生物信息学分析

作者：白雨; 马莉莉; 王丽妍; 刁宗礼; 黄红东; 刘文虎^*

来源：临床肾脏病杂志, 2023, 23(03): 234-241.

• 糖尿病肾病
• 肾小管间质纤维化
• 生物信息学分析
• 关键基因

目的 通过生物信息学分析方法探讨糖尿病肾病(diabetic nephropathy, DN)肾小管间质纤维化(renal tubuleinterstitial fibrosis, RTF)的关键基因及其临床相关性。方法 下载DN、非DN患者肾间质组织和RTF模型小鼠肾组织数据集，筛选差异表达基因，识别DN特异性RTF相关基因，并进行功能富集和蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction, PPI)分析，筛选出关键基因后进行临床相关性分析。结果 共获得125个DN特异性RTF相关基因。生物学功能富集分析提示上述基因与免疫反应及代谢过程相关，并富集到了Toll样受体、核因子-κB、肿瘤坏死因子和趋化因子等信号通路。基于PPI网络分析筛选了ITGAM、TLR2、LCP2、TLR7、IL10RA作为关键基因，在DN组表达差异倍数显著高于对照组，且受试者工作特曲线的曲线下面积分别为1、0.925、0.9583、0.9583、0.8833(P<0.01)。关键基因的表达水平与估算肾小球滤过率的Pearson相关系数(r值)分别为-0.7956、-0.6463、-0.752、-0.7136、-0.7721(P<0.05)。结论 本研究筛选了DN特异性RTF关键基因，其与估算肾小球滤过率呈负相关，并可能通过免疫炎症反应途径参与DN-RTF过程。

• 单位
  首都医科大学附属北京友谊医院