‘红地球’葡萄花芽分化过程中的转录组分析

作者：刘鑫; 张亚红^*; 袁苗; 党仕卓; 周娟

来源：中国农业科学, 2022, 55(20): 4020-4035.

• ‘红地球’葡萄
• 花芽分化
• 转录组测序
• 植物激素
• MADs-box

【目的】葡萄是我国重要的果树树种，花芽分化直接影响葡萄的质量和数量。对‘红地球’葡萄花芽分化过程中的花芽进行比较分析，探索‘红地球’葡萄花芽分化机制，挖掘关键基因，为了解‘红地球’葡萄花芽分化提供理论基础。【方法】对‘红地球’葡萄花芽分化过程中4个发育阶段：S1（未分化期）、S2（花原始体发育期）、S3（花序主轴发育期）和S4（花序二级轴发育期）的芽进行形态学观察和植物激素测定，并进行转录组测序分析及验证。【结果】‘红地球’葡萄花芽分化过程中共发现13 729个差异基因，其中S1-S2、S2-S3、S3-S4和S1-S4分别有4 158、2 050、3 425和7 652个差异基因。在S1-S4差异基因的富集调控网络中发现差异基因在激素介导的信号通路、脱落酸代谢过程、对酸性化学物质的反应和植物细胞壁组织或生物发生等通路富集。在激素介导的信号通路中发现大量与生长素、赤霉素和脱落酸等相关基因，测定表明，生长素在S2时期含量最高，而在S3和S4时期含量最低；赤霉素含量在花芽分化过程中不断降低，在S4时期为S1时期的80%；脱落酸含量在S1和S4时期较高，而在S2时期最低。此外，S1-S4差异基因来自转录因子家族（MYB、ERF、bHLH和MADS-box等），表明这些转录因子家族基因参与了‘红地球’葡萄花芽分化。对差异表达的13个MADS-box家族基因进一步分析表明，MADS8、AGL65、AGL15、AGL12和MADS2在花芽分化进程中表达上调，而AGL30、LeMADS、FBP24、AGL14和MADS3表达下调。对这些MADS-box基因进行qRT-PCR验证，基因表达趋势与转录组数据一致且相关系数较高，表明数据分析结果可靠。【结论】‘红地球’葡萄花芽分化是一个复杂的生物过程，其中，植物激素介导的信号通路以及MADS-box家族基因在花芽分化中发挥重要作用。研究结果提供了一个关于转录因子、基因和激素的信息，有助于揭开这一复杂的发育过程，并为‘红地球’葡萄花芽分化综合模型的建立提供理论基础。

• 单位
  宁夏大学