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摘要
种子发芽耐受性及发芽耐低氧相关基因的发掘与应用，是直播稻新品种培育的前提，研究种子发芽耐低氧成苗特性，对提高直播稻产量具有重要意义。采用200份东乡野生导入系成熟的水稻种子，进行了正常萌发试验、淹水低氧萌发试验和遗传谱图构建、筛选候选基因的实验。结果表明，水稻群体内耐淹萌发性状存在广泛的表型变异。主要成分分析说明水稻群体内部存在明显的群体结构，这种结构对于关联分析有着较强的影响。利用主要成分作为关联分析的协变量，可以提高关联分析的准确度。对200份材料的耐淹水稻干重进行全基因组关联分析，共检测到了10个与耐淹水稻干重相关的SNP位点，基于水稻基因组注释，通过LD衰减水平，在关联SNP位点上下游区域检测到227个基因，其中9个为关联候选基因。在此基础上，通过全基因组关联分析，构建了一张高密度遗传连锁图谱，获得了多个关键QTL。研究结果将为今后选育耐涝水稻新品种奠定基础，对提高直播稻育种水平具有重要的理论与现实意义。
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