基因芯片表达数据的标准化策略研究

作者：伍亚舟; 张彦琦; 黄明辉; 杨梦苏; 曾志雄; 易东

来源：第三军医大学学报, 2004, (07): 594-597.

DOI：10.16016/j.1000-5404.2004.07.014

• 基因芯片(微阵列)
• 标准化因子
• 表达比
• 显著性差异 gene chip (microarray)
• normalization factor
• expression ratio
• significant difference

目的　从统计学、数学和生物信息学相结合的角度 ,探讨针对不同密度基因芯片 (microarray ,genechip)如何进行数据标准化处理与分析 ,寻找表达上有显著性差别的基因。方法　在Excel和Spss软件中 ,采用总强度标准化法 (totalintensitynormalization ,TIN )和局部加权线性回归标准化法 (locallyweightedlinearregressionnormalization ,LWLRN)对高低密度芯片数据进行分析处理。结果　这些方法能有效地减少系统误差产生的影响 ,使处理后的数据更加具有可比性和可靠性。结论　本研究提供的分析方法在减少系统误差...

• 单位
  香港城市大学深圳研究院; 第三军医大学; 香港城市大学