基于iTRAQ技术研究系统性硬皮病患者皮损组织蛋白组学变化

作者：徐爱国; 周梅; 毛静; 熊霞; 邓永琼; 刘杰雄^*

来源：中国皮肤性病学杂志, 2020, 34(12): 1379-1384.

DOI：10.13735/j.cjdv.1001-7089.202005024

• 系统性硬皮病
• 差异蛋白
• iTRAQ技术

目的通过iTRAQ定量蛋白质组学技术研究系统性硬皮病患者皮损组织与健康对照的正常皮肤组织的蛋白表达差异。方法收集16例系统性硬皮病患者皮损组织及健康对照的正常皮肤,提取样本总蛋白,采用iTRAQ定量蛋白质组学技术研究两组间的差异蛋白,同时采用软件Goatools对差异蛋白进行GO信号富集。结果本研究中55.75%的蛋白质序列覆盖率占整个蛋白序列的比率超40%。硬皮病皮损组织与对照组皮肤相比较,共获得2 161个差异表达蛋白(P<0.05);如以P<0.001,FC>1.2/FC<0.83为统计界值,差异表达蛋白仅17个,其中与纤维化相关的蛋白如软骨寡聚基质蛋白(COMP)、肌腱蛋白(Tenascin)明显上调。另外,采用软件Goatools对所有的差异蛋白进行GO信号富集分析发现:上调的信号通路256个,下调的190个。在富集率前20的通路中,JAK-STAT通路的正负调节通路、血管重建通路、硫酸皮肤素代谢通路富集比率在硬皮病患者皮损中比对照组有明显升高,而胶原纤维代谢通路、脂肪酸代谢通路富集率则有明显降低。结论 iTRAQ定量蛋白质组学技术筛选出了系统性硬皮病皮损组织与健康志愿者正常皮肤组织间的差异蛋白及差异信号通路,为该病发病机制及治疗新靶点的进一步研究提供了方向。

• 单位
  西南医科大学