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摘要
植物DNA甲基化是与调控基因表达、基因组防御等相关的修饰方式，其中DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase， DNMT)催化完成DNA甲基化反应过程。本研究利用毛竹全基因组和转录组数据信息，从毛竹全基因组中筛选鉴定出8条具有DNA甲基转移酶保守结构域的DNMT基因。这8个基因根据系统进化分析可分为4个亚家族：MET1亚家族、CMT亚家族、DRM亚家族和DNMT2亚家族，进一步发现每个亚家族的毛竹DNMT基因与水稻(Oryza sativa) DNMT基因的亲缘关系都比较接近。亚细胞定位分析发现有7个DNA 甲基转移酶定位在细胞核中，蛋白结构域比对结果显示，8个蛋白的C端均具有DNA methylase 结构域，而 N 端调节功能域的差异将蛋白分为四类，其中DNMT2亚家族的蛋白缺少 N 端调节结构域。顺式作用元件预测分析结果表明，在毛竹DNMT家族启动子区具有光应答、激素应答、逆境胁迫相关的顺式作用元件，推测DNMT基因有利于毛竹应对冷热胁迫、干旱等恶劣环境。毛竹DNMT基因在不同组织器官中均有表达，总体上看，在毛竹叶和鞭组织中的表达量略高于花和根，同时家族成员间的表达量也存在一定差异。通过对毛竹DNMT基因家族的生物信息学分析，本研究为进一步揭示毛竹DNMT基因家族的功能铺垫了道路。
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