针对高校软件工程学科普遍存在的软件工程硕士招生中本科为非本专业的学生占比高的问题,提出以学科交叉科研合作助力培养"跨学科"的硕士生,从学科交叉科研课题的选择、有效交流方式的建立、团队建设方法、长期合作模式的必要条件等方面探讨复合型、创新型研究生培养的一些关键问题,并通过实践案例说明效果。