白耳黄鸡三叉冠性状分析

作者：张文武; 邱峰芳; 许继国^*

来源：广东农业科学, 2022, 49(12): 118-123.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874X.2022.12.013

• 全基因组关联分析
• 单核苷酸多态性
• 常染色体遗传
• 种蛋受精率
• 鸡冠型

【目的】对白耳黄鸡三叉冠性状进行分析，以期寻找与三叉冠性状相关的候选单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms, SNP）位点。【方法】60只白耳黄鸡用于杂交试验，120只白耳黄鸡用于受精率试验。对82只白耳黄鸡采集血样抽提DNA，用Illumina鸡60 k芯片进行基因型分型，利用PLINK 1.90对分型结果进行质控后，采用GEMMA软件对SNP与性状进行全基因组关联分析（Genome-wide Association Analysis,GWAS），寻找与白耳黄鸡三叉冠性状显著相关的SNP位点。【结果】白耳黄鸡三叉冠呈现常染色体遗传，其种蛋受精率与单冠的白耳黄鸡差异不显著。由82只白耳黄鸡群体得到55 023个有效SNP，群体内不存在明显的群体分层。与三叉冠相关的SNP位点有10个，分别位于第1、2、3、4、5、12、14号染色体上，邻近或座落于SPRY2、NDFIP2、ITGA9、EMC2、TMEM17、EHBP1、SCAF8、TIAM2、HTT、STON2、PRKCD、RBBP6、TNRC6A、MAPK8IP3基因上。【结论】通过GWAS分析发现10个SNP位点可能与白耳黄鸡三叉冠性状相关。研究结果将为白耳黄鸡的育种提供候选分子标记，为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。

• 单位
  南昌师范学院; 东华理工大学