基于比较转录组的延胡索组织差异性表达分析

作者：赵雪艳; 王琪; 王莉; 王方圆; 王庆; 李艳^*

来源：园艺学报, 2023, 50(01): 177-187.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2021-0822

• 延胡索
• 异喹啉生物碱
• 转录组
• 表达分析

延胡索(Corydalis yanhusuo)干燥块茎为传统中药,异喹啉生物碱类化合物是其主要的活性成分。采用Illumina高通量测序技术对延胡索块茎、根茎和叶片组织进行转录组测序,鉴定异喹啉生物碱生物合成的相关酶基因,并分析3种组织间的差异表达基因。在块茎vs.根茎、块茎vs.叶、根茎vs.叶比对中分别鉴别到6 161、8852和5 772个差异表达基因。差异表达基因的KEGG富集分析表明,核糖体、淀粉和蔗糖代谢途径,苯丙素生物合成途径,植物激素信号转导途径以及异喹啉生物碱生物合成途径是主要的富集途径。其中47个转录本与延胡索异喹啉生物碱生物合成相关,其在块茎中的表达量最高,根茎次之,叶中的表达量最低。

• 单位
  医药学院; 陕西省西安植物园; 陕西国际商贸学院