摘要
目的:探讨人类APOBEC3七个蛋白结构与功能的相似与不同之处,为进一步深入研究APOBEC3的功能和抗病毒药物的开发提供参考。方法:采用生物信息学方法对APOBEC3的七个蛋白进行了理化性质、亚细胞定位、跨膜结构及相互作用蛋白的预测分析。结果:发现人类APOBEC3均为亲水性的非跨膜蛋白,除APOBEC3H主要定位于细胞核,其余APOBEC3蛋白主要定位于细胞质;APOBEC3的二级结构非常相似,只有APOBEC3Fα螺旋所占比例最高,其余APOBEC3以无规则卷曲所占比例最高;APOBEC3DE、APOBEC3F可能还参与了细胞色素C的电子传递;APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3C参与DNA修饰过程,A3H参与DNA去甲基化过程,提示APOBEC3A、APOBEC3B、APOBEC3C和APOBEC3H可能参与基因突变,导致基因组的不稳定与癌症等疾病发生;APOBEC3G参与病毒的防御应答,提示APOBEC3G具有广谱抗病毒功能。结论:人类APOBEC3是具有脱氨酶活性和水解酶活性的保守蛋白家族,可参与多种生物过程,生物学功能比较复杂。
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