南海北部陆坡表层沉积物氨氧化古菌多样性初探

作者：刘国辉; 吴后波

来源：热带地理, 2015, (01): 108-113.

• 氨氧化古菌
• amoA基因
• 表层沉积物
• 南海北部 Ammonia-Oxidizing Archaea
• amo A gene
• surface sediment
• northern South China Sea

基于南海北部陆坡不同深度梯度3个站位表层沉积物古菌氨单加氧酶基因(amo A)文库,对3个站位氨氧化古菌进行多样性和系统发育学分析。多种方法构建的系统发育树表明:3个站位所有的amo A基因序列都隶属于奇古菌门中Group I分枝内的Group I.1a系群,且各站位之间氨氧化古菌多样性没有明显的差异。501站位黑色砂质沉积物中古菌amo A基因与该站位的16S r RNA基因的系统发育比对显示:这2种基因标记的系统发育树整体上具有潜在的对应关系,说明对样品的氨氧化古菌多样性分析比较全面且可靠;并进一步暗示该样品中氨的硝化作用主要由奇古菌门下的Group I.1a系群来执行。由此可以推测:Gr...

• 单位
  中国科学院大学; 中国科学院南海海洋研究所