狗枣猕猴桃AkSAP蛋白的生物信息学分析

作者：刘丹; 李然红; 陈鑫; 王立凤

来源：河南农业科学, 2019, 48(12): 103-108.

DOI：10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.12.015

• 狗枣猕猴桃
• 锌指蛋白
• 生物信息学

为研究狗枣猕猴桃锌指蛋白(AkSAP)的功能,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明,AkSAP的cDNA全长为2 089 bp,编码区(CDS)为1 431 bp,编码蛋白为由477个氨基酸构成的非稳定亲水蛋白,属于SAP蛋白家族成员(ID:10488483),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,包含锌指蛋白特有的SAP结构域,与其他17种植物的SAP氨基酸序列进行对比,与中华猕猴桃变种亲缘关系较近。

• 单位
  牡丹江师范学院