基于宏基因组二代测序技术检测社区获得性肺炎患者病原体的分布特征研究

作者：乔薇^*

来源：临床急诊杂志, 2022, 23(09): 660-663.

DOI：10.13201/j.issn.1009-5918.2022.09.010

• 宏基因组二代测序
• 社区获得性肺炎
• 重症社区获得性肺炎
• 病原体

目的:利用宏基因组二代测序(mNGS)检测社区获得性肺炎(CAP)患者的感染病原体，分析其分布特征，为此类患者初始经验性抗感染策略的制定提供依据。方法:分析2020年7月-2022年2月我院呼吸内科、ICU收治的CAP患者痰液及支气管肺泡灌洗液的mNGS结果，归纳此类患者的病原体种类特征。结果:共纳入45例患者，mNGS检出阳性患者44例，细菌检出率最高(33/45,73.33%),其次为病毒(22/45,48.89%)、非典型病原体(12/45,26.67%)、真菌(6/45,13.33%)及分枝杆菌(2/45,4.44%)。入选患者中，CAP 20例(CAP组),重症社区获得性肺炎(SCAP)25例(SCAP组),两组患者呈现出与总体情况相似的病原学分布特征。结论:利用mNGS技术检测到CAP患者非典型病原体占比有增高趋势，特别是SCAP患者，在初始经验性选择抗生素时应考虑覆盖G-、G+细菌及非典型病原体。

• 单位
  首都医科大学