国务院特殊津贴制度实行30余年,对我国改革开放事业起到了巨大的推动作用,对稳定人才队伍、建立现代人才评价体系与奖励机制也起到示范作用。科技强国建设人才先行,好的人才政策的制定一定是基于人才的能力区间与偏好分类靶标来设计的。为此,考察特殊津贴制度的缘起、发展现状以及存在的问题,可以发现这项人才奖励政策的功能定位存在问题:从补偿性功能向承认性功能的转变存在着功能定位混淆、奖励错置的问题。在此基础上,提出特殊津贴制度应该向荣誉功能彻底转变的改革建议。