大戟叶绿体基因组特征与系统关系分析

作者：王玉良; 王松^*

来源：安徽科技学院学报, 2022, 36(03): 45-51.

DOI：10.19608/j.cnki.1673-8772.2022.0019

• 大戟
• 叶绿体基因组
• 大戟科
• 系统发育

目的:在高通量测序的基础上，对大戟(Euphorbia pekinensis)的叶绿体基因组进行研究，并开展系统发育分析，以便为大戟科和大戟属的系统界定提供资料。方法:利用Illumina HiSeq测定叶绿体基因组DNA序列，使用GetOrganelle组装，GeSeq进行基因注释。在此基础上，以黄杨木(Buxus microphylla)和顶花板凳果(Pachysandra terminalis)为外类群，利用MEGA X构建大戟科24个物种的最大似然树，探讨大戟的系统位置。结果:大戟的叶绿体基因组由1个大单拷贝区(LSC,88 184 bp)、1个小单拷贝区(SSC,26 519 bp)和2个长度为18 967 bp的反向重复区(IRa和IRb)组成，呈典型的四段式结构。序列总长度162 002 bp, GC值为35.7%。基因组共有129个基因，其中蛋白质编码基因85个(含9个重复基因)、rRNA基因8个(含4个重复基因)、tRNA基因36个(含16个重复基因)。系统发育分析表明，大戟和甘肃大戟(E.ebracteolata)互为姊妹类群，亲缘关系最近(支持率100%);大戟科系统树上的所有节点的支持率都比较高。结论:大戟叶绿体基因组的测序、组装、注释和序列分析为大戟科和大戟属遗传多样性研究和系统界定提供基础信息。

• 单位
  安徽科技学院