摘要
为深入挖掘影响荷斯坦奶牛乳脂代谢的关键候选基因,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)技术检测课题组前期通过转录组和加权基因共表达网络分析(WGCNA)得到的15个候选差异基因的组织表达谱。确定乳脂代谢关键候选基因后检测其在原代奶牛乳腺上皮细胞(BMECs)中的定位,并进行克隆测序,以及结构和功能分析。结果表明,ENPP2、PI4K2A、CTSH和PTPRR基因在乳腺组织中的表达水平均高于其他组织,同时PI4K2A和CTSH在乳腺组织和原代BMECs中的表达相对于其他基因处于较高水平。通过qRT-PCR结合前期转录组测序的结果,最终确定PI4K2A为调控奶牛乳脂合成的关键候选基因,其主要在BMECs的细胞质中表达。克隆测序发现,奶牛PI4K2A基因编码区(CDS)全长1 440 bp,编码479个氨基酸。结构和功能分析表明,PI4K2A为非分泌型且不稳定的亲水蛋白,含有40个磷酸化位点,翻译后的修饰作用非常丰富。PI4K2A蛋白的二级和三级结构均以无规则卷曲为主,α螺旋次之,且在不同物种中具有较高的保守性。本研究确定PI4K2A为奶牛乳脂代谢的重要候选基因,研究结果可以为奶牛乳脂代谢的分子调控机制研究提供理论依据。
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单位宁夏农垦贺兰山奶业有限公司; 宁夏大学