BAIAP2L2在肝癌中的表达及临床意义

作者：屈才浩; 马腾达; 王瑞; 李晓梅; 李玉民^*

来源：生命科学研究, 2022, 26(05): 441-451.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2021.04.0153

• 肝癌
• 脑特异性血管生成抑制剂1相关蛋白2样2(BAIAP2L2)
• 癌症基因组图谱(TCGA)
• 预后

脑特异性血管生成抑制剂1相关蛋白2样2(brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2-like 2, BAIAP2L2)是一种上皮特异性BAR结构域蛋白,近年来被发现在多种肿瘤中高表达,然而在肝癌中的角色尚不清楚。本文通过生物信息学方法,探讨了BAIAP2L2在肝癌中的表达、生物学意义及潜在的临床应用价值,旨在为BAIAP2L2作为肝癌的新型标志物提供理论依据。文中首先从TCGA和ICGC数据库下载肝癌m RNA-seq、mi RNA-seq、DNA甲基化数据及临床病理资料,从HPA数据库获取蛋白质表达数据,以比较癌组织和癌旁组织中BAIAP2L2的表达差异,分析BAIAP2L2表达与肝癌临床病理特征的关系。随后,采用受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线评估BAIAP2L2表达水平在肝癌诊断中的性能,通过绘制生存曲线比较不同BAIAP2L2表达组患者的生存差异,并利用Cox回归计算风险比(hazard ratio, HR)。最后,利用mi RWalk数据库预测BAIAP2L2的潜在调控因子,采用TIMER数据库分析BAIAP2L2表达与肝癌组织中浸润免疫细胞的相关性,借助基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)探讨BAIAP2L2涉及的功能通路。结果显示:BAIAP2L2在肝癌组织中的表达水平显著高于癌旁组织(P<0.001),对肝癌具有较好的诊断价值(AUC=0.891, P<0.001),且BAIAP2L2的表达水平与患者性别、T分期、甲胎蛋白(alpha fetoprotein, AFP)、临床分期和存活状态均显著相关(P<0.05); BAIAP2L2高表达患者预后更差(P<0.05),且BAIAP2L2是肝癌患者独立预后的危险因素(HR:1.522, 95%CI:1.044～2.219, P<0.05);BAIAP2L2甲基化与其表达水平呈显著负相关(P<0.001),且BAIAP2L2低甲基化患者的预后更差(P<0.05); hsa-miR-99a-3p是一个可以调控BAIAP2L2表达的因子; BAIAP2L2表达与肝癌组织中B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突细胞的浸润水平均显著相关(P<0.05); BAIAP2L2在肝癌中参与调节细胞周期、p53信号通路、同源重组等通路。总之, BAIAP2L2在肝癌中高表达,其中涉及多种作用机制,可作为肝癌的潜在诊断和预后标志物。

• 单位
  甘肃省消化系肿瘤重点实验室; 兰州大学第二医院